Pour organiser les différents composants de l'interface graphique (widgets) PyGTK propose un système de boites (box) qui sont des conteneurs invisibles à l’intérieur desquels on insère les widgets. Il existe deux familles: les conteneurs verticaux et les horizontaux. Dans un conteneur horizontal, les objets insérés sont placés les un à la suite des autres en file indienne. Dans un conteneur vertical, les objets seront disposés verticalement les uns sous les autres. Les boites s'imbriquent à volonté afin de produire l'effet désiré.

Les propriétés des boites permettent de définir leur comportement pour occuper l'espace disponible:

• PyGTK 2.0 Tutorial, chapitre 4